当高速电机主轴工作时，内置电机和滚动轴承在旋转过程中会产生大量热量。由于电机具有结构紧凑、间隙小、自发散热效果弱的特点，如果散热不及时，会引起内部零件之间不同程度的热膨胀，从而影响电机主轴刚度和加工精度的性能参数。这将严重影响高速电机的使用寿命。对于高速电机的整体冷却，通常有两种方式：水冷和风冷。

水冷是指高速电机内部冷却水循环的设计，外部配备相应的冷却机，使冷却液在主轴内部循环，带走内部热量。这种冷却方法的优点是设计简单可靠，冷却效果更加明显。

风冷却是指在高速电机壳体和电机定子之间设计强制对流通道。电机的热量通过热传导进入强制对流区域，最后将热量带入空气中，实现高速电机恒温工作。空气冷却无污染。如果使用静压气体轴承，静压气体轴承的气体可用于在主轴内循环，以带走电机的部分热量。